Les cellules humaines, comme les personnes qu’ils créent, sont dynamiques et complexes. Et bien que les chercheurs puissent créer des photographs et des vidéos de la façon dont ils se déplacent, organisent et changent leurs propriétés, il est difficile de décrire efficacement et avec précision tout ce qui se passe.
Ainsi, une équipe de 75 personnes du Seattle à however non lucratif Allen Institute se lance dans un projet de 10 ans appelé Cellules Pour concevoir une nouvelle langue en utilisant les mathématiques pour capturer ces processus essentiels.
«C’est une nouvelle façon d’approcher la biologie cellulaire très fondamentale», » Ru GunawardaneDirecteur exécutif et vice-président de l’Allen Institute for Cell Science, a déclaré à GeekWire. «Nous voulons combiner la modélisation mathématique et biophysique, qui sont des choses que les gens font en ce second, mais d’une manière cloisonnée dans des systèmes très différents.»
L’Institut Allen a été fondé il y a plus de 20 ans par le regretté co-fondateur de Microsoft, Paul Allen, et sa sœur Jody Allen pour plonger dans des problèmes difficiles dans les biosciences.
Les efforts antérieurs dans plusieurs establishments ont créé des systèmes numériques pour comprendre les processus biologiques. Qui comprend Espace de baieun outil de calcul qui produit des données sur l’expression des gènes dans des varieties de cellules mixtes qui ont développé des chercheurs du Fred Hutch Most cancers Heart. L’Institut Allen a une modélisation conçue pour les organites, qui sont les différentes machines emballées à l’intérieur des cellules qui fabriquent des protéines, produisent de l’énergie et effectuent d’autres opérations clés.
« Ce qui est excitant, c’est que nous essayons … de rassembler différentes disciplines », a déclaré Gunawardane, « parce que les données sont partout – mais remark donnez-vous un sens à ces données? »
Les chercheurs de cellules de scaps travaillent avec des cellules souches humaines, qui sont des cellules qui n’ont pas encore une identité définie comme, par exemple, une cellule cutanée ou hépatique. L’espoir est que par l’analyse et l’expérimentation, ils concevront des mathématiques qui décrivent le comportement de la cellule, leur permettant finalement de prédire et de manipuler ce que font les cellules.
Un objectif principal serait d’utiliser ces outils pour démêler des mystères tels que les étapes intermédiaires pour développer un most cancers, et finalement découvrir de nouvelles thérapies cellulaires.
«C’est un peu comme l’astronomie et passer de« quelle planète est ce level dans le ciel »à« Quelles sont les lois du mouvement qui décrivent tous les objets en mouvement? »», A déclaré Wallace Marshall, professeur de biochimie et de biophysique à l’Université de Californie à San Francisco, et un conseiller de paysages cellulaires, dans un communiqué.
L’Institut Allen rendra ses données et ses improvements dans l’espace accessible au public, a déclaré Gunawardane, et prévoit de collaborer avec des chercheurs dans des establishments externes. L’équipe de recherche comprend des ingénieurs logiciels, des biologistes informatiques, des gestionnaires de programmes et autres.
Il n’y a pas de price range défini pour l’effort d’une décennie, et l’équipe CellCapes poursuit simultanément trois projets qui font partie de l’initiative plus giant. L’effort a déjà un article scientifique accepté par la revue Nature qui sera publié dans les prochains mois.
C’est une période passionnante, a déclaré Gunawardane.
«Je ressens aussi une énorme responsabilité», a-t-elle dit, «parce que Paul [Allen] n’est plus vivant, mais notre travail est son héritage, et il nous a demandé de briser le code de la cellule. Et d’une certaine manière, le code est très compliqué – c’est plus comme un programme, le programme cellulaire.
«J’ai donc l’impression que nous sommes maintenant au bord du bord», a-t-elle dit, «de savoir peut-être remark aborder cela.»
